apt-get コマンドや rpm コマンドでパッケージのインストールやアンインストールなどを行ったときに
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といった状態で停止して、いつまで待っても処理が終わらない場合、synaptic が起動していないか確認して、起動していたら synaptic を終了してください。
synaptic でパッケージの更新やインストールやアンインストールなど、なんらかの作業を行った後、synaptic を起動したままにしていると、rpm のデータベース(どのパッケージがインストールされているかなどの情報)を synaptic がロックしたままになっていて、他のコマンドは順番待ちの状態になります。 synaptic を終了すると、ロックが解除され、apt-get コマンドや rpm コマンドが続きの処理を行うことができるようになり、コマンドの処理が再開します。